Na przełomie 1989 i 90 roku spotkali się Jeff Ament i Stone Gossard (poprzednio razem grali w Green River i Mother Love Bone). Dołączyli do nich: Mike McCready - gitara, Dave Krusen - perkusja. Na końcu doszedł nieśmiały surfer z San Diego, polecony przez Jack Ironsa (pierwszy perkusista Red Hot Chili Peppers), wokalista i wspaniały autor tekstów - Eddie Vedder. Pearl Jam (początkowo nazywali się Mookie Blaylock) podpisał kontrakt z wytwórnią Epic i pod jej skrzydłami wydali debiutancki album "Ten", który ukazał się w sierpniu 1991 roku.

Wkrótce po nagraniu płyty, zespół opuścił Dave Krusen. Na krótko zastąpił go Matt Chamberlain (kiedyś grał z Eddie Brickel & The New Bohemians obecnie w Critters Buggin'). Jednak w sierpniu 1991 roku w zespole zameldował się stały perkusista Dave Abbruzzese. Płyta "Ten" osiągnęła niewiarygodny sukces - ponad 100 tygodni na liście Billboardu; sprzedaż: ponad 10 milionów egzemplarzy!!! Zespół przez dwa lata koncertował na całym świecie oraz brał udział w rozmaitych tzw. side project'ach; m.in. "Judgment Night", "Sweet Relief". Stone Gossard wydał płytę "Shame" pod nazwą Brad, natomiast Eddie Vedder gościnnie wziął udział w nagraniach płyty Bad Religion "Receipe For Hate".

W październiku 1993 ukazała się druga płyta Pearl Jam pod tytułem "Vs". Tym razem produkcją albumu zajął się Brendan O'Brien (znany ze współpracy z Red Hot Chili Peppers i Black Crowes). Drugi album grupy z Seattle niesie 46 minut muzyki przedstawionej w 12 odsłonach. Muzyki innej niż ta, która wypełniała "Ten". Mniej bombastycznej. Szybszej. Ostrzejszej, ale zarazem dojrzalszej. Zyskującej wraz z każdym przesłuchaniem.17 października '93 podczas pierwszego dnia sprzedaży "Vs", sklepy opuściło aż 350 tysięcy egzemplarzy tego albumu! Rekord, lecz nie jedyny ustanowiony przez drugą dużą płytę Pearl Jam. Bo w ciągu pierwszego tygodnia na zakup "Vs" zdecydowało się ponad milion osób. A potem znalazło się jeszcze 5 milionów chętnych. I to przy znikomej promocji. Zespół postanowił, że nie będzie nagrywać teledysków i od 1994 roku prawie nie gra koncertów. Postanowili bowiem zbojkotować megaagencję koncertową Ticketmaser (amerykański potentat koncertowy, bez udziału tej agencji bardzo trudno jest organizować koncerty), oskarżając ją o zawyżanie cen biletów. A Pearl Jam zawsze dbał o dobre interesy swoich fanów.

Mimo działań antypromocyjnych, popularność zespołu nie malała. W grudniu 1994 roku ukazał się trzeci album kwintetu z Seattle pt.: "Vitalogy". I znowu w pierwszym tygodniu sprzedaży ze sklepów ulotniło się milion egzemplarzy płyty. No i oczywiście później "Vitalogy" znalazła 8 milionów nabywców!!! W sierpniu '94 z zespołu wyrzucony został perkusista Dave Abbruzzese. W kilka miesięcy później na jego miejsce wskoczył wieloletni przyjaciel zespołu, i odkrywca Eddiego, Jack Irons. Przy promocji płyty "Vitalogy" Pearl Jam koncertował bardzo mało w USA (w Europie w ogóle) - cały czas chodziło o bojkot Ticketmaster. Zagrali dwumiesięczne tourne po Japonii, Hong Kongu, Filipinach, Indonezji, Australii i Nowej Zelandii.

Po wielomiesięcznej przerwie Pearl Jam wydali czwarty album "No Code", który nagrywali w różnych studiach w Seattle, Atlancie i Chicago. Premiera: 26 sierpnia 1996 r. Do płyty wydane były 3 single. Grupa odbyła trasę koncertową po Stanach Zjednoczonych i Europie. 1 listopada '97 zagrali na warszawskim Torwarze.

Potem nastąpiło długie milczenie. Pearl Jam nie udzielał wywiadów, nie pokazywał się w telewizji, kompletna cisza. Przygotowywał się jednak do nagrania piątego albumu. Większość czasu wiosny i lata 1997 r. zespół spędził w studiu Litho w Seattle pod czujnym okiem Brendana O'Briena, który jest współproducentem płyty, która nosi tytuł "Yield". Premiera albumu odbyła się 2 lutego '98.

23 listopada ukazała się pierwsza w historii zespołu, płyta koncertowa "Live On Two Legs". Została nagrana podczas trasy koncertowej po Stanach Zjednoczonych w 1998 roku. Pearl Jam występował w składzie: Eddie Vedder, Stone Gossard, Mike McCready, Jeff Ament oraz nowy perkusista Matt Cameron (poprzednio Soundgarden).

15 maja ukazał się kolejny album Pearl Jam, zatytułowany "Binaural". Producentem płyty jest sam zespół oraz Tchand Blake (Sheryl Crowe, X, Los Lobos, Crowded House, Fishbone, Matthew Sweet, Tom Waits), natomiast zmiksował Brendan O'Brien. 25 września ukazało się 25 różnych wersji podwójnego albumu koncertowego Pearl Jam. Płyty zostały nagrane podczas ostatniej europejskiej trasy zespołu. Każdy koncert doczekał się więc osobnej edycji. W tym również dwa koncerty z 15 i z 16 czerwca z katowickiego Spodka.

11 listopada 2002 r. świat poznaje album "Riot Act". Z ciekawszych nagrań warto wspomnieć utwór Bu$hleaguer, w którym Vedder krytykuje prezydenta George'a W. Busha, a także Love Boat Captain, nagrany w hołdzie ofiarom tragedii w 2001 r. na festiwalu w Roskilde.

W 2006 r., po 4 latach milczenia, zespół wydał płytę zatytułowaną po prostu "Pearl Jam". Album jest powrotem do agresywniejszego brzmienia zespołu, aczkolwiek nie brakuje na nim i ballad. Warstwa liryczna utworów skupia się na sytuacji społecznej we współczesnych społecznościach zachodnich - poruszane są takie tematy jak wojna (widziana z rozmaitych perspektyw), bezrobocie czy polityka. Nie ma jednakże bezpośrednich odwołań do konkretnych postaci bądź wydarzeń. Znalazło się też miejsce dla piosenek z tekstami bardziej osobistymi, jak na przykład ("Come Back") - wbrew pozorom nie jest to love-song lecz swojego rodzaju 'requiem' dla Johnny'ego Ramone'a.

Po premierze albumu zespół wyruszył w długą trasę koncertową obejmującą trzy kontynenty: Australię, Amerykę Północną oraz Europę. W roku 2007 Pearl Jam wznowi tournee występując kilkakrotnie na Starym Kontynencie. W ramach tej trasy grupa odwiedzi ponownie Polskę - 13 czerwca zagrają koncert na Stadionie Śląskim w Chorzowie